Первая деревянная церковь в селе Афоньевка была построена в 1792 году. В 1912 году был построен и освящён каменный храм.

В 1962 году храм был закрыт и передан колхозу. Дом Божий использовался как складское помещение вплоть до 2000-х годов. Летом 2006 года по инициативе местных жителей было принято решение о восстановлении Георгиевской церкви.