Рассказывая о 1996 годе, пресс-служба сообщает, что «21 марта 1996 года Белгородским епархиальным управлением был подписан договор о сотрудничестве с Управлением исполнения наказаний Отдела внутренних дел Белгородской области.

6 сентября 1996 года Белгородское епархиальное управление заключило соглашение о сотрудничестве с отделом здравоохранения города Белгорода.

28 сентября 1996 года – торжественное открытие Белгородской Православной духовной семинарии (с миссионерской направленностью), которое возглавил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II.

29 сентября 1996 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил чин освящения второго по величине после храма Христа Спасителя, в тот период, Спасо-Преображенского собора в городе Губкине Белгородской области. Затем во второй половине дня он посетил восстановленный храм во имя великомученика и целителя Пантелеимона в селе Долгая Поляна Старооскольского района.

С сентября 1996 года начала выходить ежемесячная православная газета «Белгородские епархиальные ведомости».

12-14 ноября 1996 года впервые после 1917 года в городе Белгороде состоялся I (VI) съезд епархиальных миссионеров Русской Православной Церкви. В работе съезда принимали участие более 130 делегатов из 73 епархий.

Первый съезд епархиальных миссио­неров предложил «Концепцию мис­сионерской деятельности Русской Пра­во­слав­ной Церкви» с внесенными поправками на окончательное рассмотрение и утверждение Священным Синодом.

Белгородское духовенство во главе с владыкой Иоанном принимало активное участие в подготовке и проведении всех последующих миссионерских съездов Русской Православной Церкви. 

Рассказывая о 1997 годе, пресс-служба сообщает, что «1 февраля 1997 года на базе Православного миссионерского молодежного центра было создано сестричество милосердия по уходу за больными и открыты двухгодичные курсы псаломщиков при Смоленском соборе города Белгорода.

10 августа – 11 сентября 1997 года состоялась первая миссионерская экспедиция священнослужителей Белгородской и Старооскольской епархии и воспитанников Белгородской семинарии в Республику Саха (Якутия).

10 октября 1997 года состоялось освящение и открытие «Территориального Центра социального обслуживания инвалидов и престарелых во имя святой блаженной Ксении Петербургской» в селе Горки Красненского района.

11 мая 1997 года совершена закладка колокольни и двух монастырских храмов во имя преподобных Антония и Феодосия Киево-Печерских и в честь Донской иконы Божией Матери и храма-часовни святого равноапостольного князя Владимира Свято-Троицкого Холковского монастыря села Холки Чернянского района».